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日本人に最適化されたSNPアレイ「ジャポニカアレイ?」を設計~約66万個のSNP情報を搭載した個別化予防?医療研究を加速する解析ツール~

東北大学東北メディカル?メガバンク機構ゲノム解析部門の長﨑正朗教授、河合洋介講師らは、日本人集団のもつSNPを高精度で取得できる全ゲノム領域を網羅する、日本人に最適化されたSNPアレイ「ジャポニカアレイ?」の設計に世界で初めて成功しました。

ジャポニカアレイ?の設計は、東北メディカル?メガバンク計画のコホート調査に協力した1,070人分の全ゲノム情報を活用し、独自のSNP選択アルゴリズムを開発?実装してスーパーコンピュータ上で解析することで実現されました。

伝子型インピュテーション(以下、インピュテーション)技術を用いることで約66万個のSNPを搭載したジャポニカアレイ?から最大2,000万SNPを取得可能です。

ジャポニカアレイ?は既存の同等数のSNPが搭載されているアレイと比べてインピュテーションの精度が10%以上向上し、また、3倍以上の数のSNPが搭載されている既存のSNPアレイとほぼ同等またはそれ以上の性能を発揮します。

この研究は、日本人に固有な体質?疾患の関連遺伝子を大規模に探索研究する為の基盤解析ツールであり、日本人の個別化予防?医療研究を加速する重要な成果です。本研究成果の詳細は、2015年6月25日(英国時間)Journal of Human Genetics誌のオンライン版で公開されました。

ジャポニカアレイ?のロゴ

詳細(プレスリリース本文)PDF

問い合わせ先

<研究内容に関すること>
東北大学東北メディカル?メガバンク機構 インシリコ解析室長
教授 長﨑 正朗(ながさき まさお)
電話番号:022-273-6051
Eメール:snparray*sc.megabank.tohoku.ac.jp (*を@に置き換えてください)

<報道担当>
東北大学東北メディカル?メガバンク機構
長神 風二 (ながみ ふうじ)
電話番号:022-717-7908
ファックス:022-717-7923
Eメール:f-nagami*med.tohoku.ac.jp (*を@に置き換えてください)

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